バックパッカー入門！海外一人旅のススメ

＞・実質出国から帰国まで12日という短期間で、マチュピチュとウユニ塩湖を回ることは可能なのか

移動の連続で目的地にはそれぞれ2～3泊しかできないと思いますが、しっかり調べて計画的に行動すれば十分可能です。

他人様のブログですが…ご参考まで。
http://ameblo.jp/outdoor-shikoku/entry-11060027667.html

無駄な移動をなくすため、日本からの往復航空券はリマin／ラパスout（もしくはラパスin／リマout）のオープンジョーにすべきです。

また、マチュピチュ行きの列車は混み合うため、事前にネットで予約しておいた方が良いでしょう。

＞・南米旅行は、治安が悪いとよく聞きますが、実際はどの程度の心積りで行けばよいか（当方の旅行歴は、インド、中国、ラオスの4か国です）

ラオスは比較的治安が良い部類ですし、中国やインドも南米に比べれば全然ましな方です。

とにかく可能な限りの防犯対策を施し、最大限の警戒心をもって臨んでください。一瞬たりとも気を抜かない、くらいの気持ちで。